Итак, заработало.
Оказалось все очень просто, берется любая флешка, форматируется под FAT,
на нее копируются файлы MSDOS2.SYS и COMMAND2.COM взятые с реального диска
или из образа диска MSX.
После этого на флешку можно копировать программы, что я и сделал.
Обьем флешки ограничен системой до 24 Мб.
Для примера запустил с флешки "Green Beret" от Konami.
Файл длиной 40 кб. грузится примерно за 4 сек.