ну по уму конечно все нужно. ну или посмотреть как там выводы по power domain`нам раскиданы.
угу. все VCCIO надо подключить. ну и для 5V tolerance VCCIO и VCCINT надо соединить. вот если IO ниже 3,3 - то надо отдельно подавать.
дело в том, что на разных группах можно получить разное VCCIO.
это все прямо следует из Pin tables: http://www.altera.com/literature/dp/max3k/epm3064a.pdf