Ты видимо слушал через обычный разъем наушников на DE1? Я уже подзабыл, как там сделан звук, но по-моему он идет через какой-то хитрый аудиокодек, который наверняка работает на чем-нибудь типа 48кГц. То есть картина получается очень похожей на то, что имеем в эмуляторах. Чтобы не было эффектов стычки ШИМа с кодеком можно было бы попробовать вывести ШИМ на ножку и послушать ее напрямую (через резистор и конденсатор).
А чтобы правильно вывести через кодек, получается надо делать настоящий ресемплер, как в v06x.