Да, чуть не забыл. Есть еще чудная вещица - MyBase называется. Обитает на http://wjjsoft.com, лечится инетом. Последняя из десктопных версий - 4.85. Что умеет - создавать базу из СД и каталогов на винте.
Хранить все документы в виде дерева. Присваивать каждой ветке свою иконку. По запросу Insert-File вставлять в документ абсолютный путь к файлу - т.е. то, о чем я говорил выше: file://C:\file.fil и открывать его связанной с ним программой простым кликом по линку. Экспортить дерево в html. Импортировать целые html странички из IE. Редактировать html, подсвечивать синтаксис кодов. Дальше я уже не вникал - но аддонов к этой программе существует прилично и умеет она многое. Уже второй раз ставлю ее себе и уже второй раз собираюсь сносить - всем хороша, но конкурирует с MS OneNote, который умеет многое, кроме каталогизации СД и вставки абсолютных путей к файлам. Рекомендую присмотреться и к МС-овскому продукту и к MyBase. Жизнь они проще делают - это однозначно.