Дык выставь приоритет загрузки и буться с него. Это нормально.
Добавлено через 1 минуту
Кстати, будте аккуратны. ЛИЧНО у меня пару раз слетала разметка диска после подключения к WINUAE. Т.е. создаю разделы, пишу туда информацию, подрубаю к ПЦ работаю с винтом в винуе, переключаю винт обратно на реал - бац! И нет разделов! Что такое? Ума не приложу.