Похоже, что это известная проблема (системы сбора статистики?) Windows, которая возникает практически во всех версиях ( Vista ещё глючит, остальные - не знаю ), когда хотя бы один из потоков процесса блокируется каким-то особым образом.

На быстродействие других процессов это не влияет, но все свободные тики (одного ядра?) убираются из System Idle и случайным (?) образом распределяются между процессами, имеющими заблокированный поток с блокировкой такого типа.

Возможно, это связано с тем, что при ожидании сигнала BREAK в COM-порту или VSYNC в видео-адаптере - Windows включает в ядре циклический опрос этих признаков.

Но т.к. это происходит в ядре - это не влияет на загруженность системы, а только на выдаваемую статистику.

В принципе, можно с этим побороться, добавив настройку, отключающую ожидание BREAK, но насколько это актуально.. Если эти 100% загрузки присутствуют только в статистике, а процессор не греется - надо ли с этим бороться..