palsw, потому-что клавиши управления в Atari800Win_PLus по умолчанию повешаны на нум-пад.
нужно изменить управление на более привычное, например стрелки + ctrl.
для этого лезь в настройки
Input ---> Joystick
и там где первый джойстик указан выбирай другую схему клавиш.
вдобавок уже несколько месяцев как вышла новая версия эмулятора
Atari 800 WinPlus 4.1
https://github.com/Jaskier/Atari800Win-PLus/downloads
а вообще я бы советовал использовать altirra, он намного более качественный, точный и продвинутый эмулятор.