Совместимость с РС и так никуда не денется, ведь CPM грузится и далее файлово работает с отдельной "не-FAT" партицией (в партиции создается файловая система CPM). В то же время на том же носителе могут быть рядом размечены и другие партиции (FAT) с которыми работает РС. Конечно, для копирования из CPM-партиции в FAT-партицию нужны дополнительные утилиты (как на РС, так и на Орионе). На Орионе такая утилита мной написана - fat.com (частично портирована, частично написана). На РС пока возможно пофайлово работать только с образом CPM-партиции, а образ партиции считывать и записывать целиком (но это от лени - можно сделать чтобы и писало напрямую в носитель).