luzanov, там есть кнопочка с четырьмя разноцветными квадратиками, нажимаешь ее, ненужные слои отключаешь (клавиша "-"), нужным присваиваешь черный цвет. при печати оставляешь открытыми отверстия (keep drill holes open).
прошивки исправленные выложу на днях.