Эти вопросы давно решены. Для этого оставлены свободные пины - хоть экран, хоть клавиатуру - бери и подключай.
Если предполагается наличие системного разъёма на шину NemoBus, и работа с док-станцией, то необходимо предусмотреть возможность подключения одним движением, как это обычно и делается в док-станциях. Т.е. сигналы VGA, клавиатуры, мыши, стереозвука, и возможно (но не обязательно) джойстиков должны выводиться на печатный краевой разъём. Таким образом втыкание и вытыкание мобильной части компьютера производится одним движением, а вся периферия уже подключена к док-станции.
Ессно, что компьютер в таком исполнении, должен иметь свой экран и органы управления, необходимые при мобильном использовании. В качестве органов управления лучше всего использовать два встроенных джойстика, справа и слева от экрана по типу приставочных геймпадов. Управление можно организовать по принципу описанному здесь: http://zx.clan.su/forum/7-11-1